- ○地球圏システム科学講座
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地球圏物質，地球圏テクトニクス，地形科学の研究分野を含み，地球内部・表層の構造，その時間的変化・テクトニクス（陸，海分布の時間変化を含む），および現在の活発な地球活動に伴う自然災害の予測・予防を中心とした教育・研究を行う。
- ○地表環境動態学講座
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地球環境は，人間活動による環境負荷の増大，対応して変動する地球システムにより，温暖化だけでなく，砂漠化，生物多様性の減少，異常気象の頻発など，これまでに経験したことのない状況になろうとしている．本講座は，水循環を中心とした水環境科学研究分野と，表層環境を中心とした地球表層環境科学研究分野の２分野からなる．生命を育む惑星としての地球表層の環境動態を，水・エネルギー・物質のフローをキーに，リモートセンシングを主要な手法の一つとして，教育・研究する。
- ○生命システム科学講座
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生命システムの進化・多様化のメカニズム，生態系の動態，生命システム制御に焦点をおき，教育・研究を行う。具体的には，進化生物学，生態系科学の教育分野からなり，進化生物学分野では現存する生命体と化石生物，さらに海嶺上の熱水噴出部に出現する原始生命体（たんぱく質）をも対象にして，地球進化にカップルした動・植物生命体の進化，遺伝子制御システムの進化，多様化の歴史的経過を，その分子的基盤である遺伝子の変異・多様化から解明するとともに遺伝子変異が多様な種の確立に到達する内因的，外因的メカニズムを解きあかす。また，生態系科学分野では多様な生物群の歴史的，未来的な推移を，生物群の分布，構造，動態，成因，相関，生理機能，存立基盤の変動など多角的な視点から解析，理論化して，環境のグローバリゼーションに対応した学問を構築する。
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